Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2R2Q712K3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2R2Q712K3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2R2Q712K3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2R2Q712K3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2R2Q712K3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms