Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP34Q70CQ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP34Q70CQ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP34Q70CQ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP34Q70CQ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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