Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STXBP4Q6ZWJ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STXBP4Q6ZWJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STXBP4Q6ZWJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STXBP4Q6ZWJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STXBP4Q6ZWJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STXBP4Q6ZWJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STXBP4Q6ZWJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms