Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT7Q6ZNI0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT7Q6ZNI0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT7Q6ZNI0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT7Q6ZNI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT7Q6ZNI0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT7Q6ZNI0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT7Q6ZNI0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms