Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEX3BQ6ZN04 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEX3BQ6ZN04 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEX3BQ6ZN04 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEX3BQ6ZN04 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms