Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD1Q6UXZ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD1Q6UXZ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD1Q6UXZ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms