Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NXPE4Q6UWF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE4Q6UWF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE4Q6UWF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE4Q6UWF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE4Q6UWF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms