Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK4Q6UW60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK4Q6UW60 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCSK4Q6UW60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK4Q6UW60 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms