Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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LCN12Q6JVE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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LCN12Q6JVE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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LCN12Q6JVE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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LCN12Q6JVE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LCN12Q6JVE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LCN12Q6JVE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LCN12Q6JVE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LCN12Q6JVE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LCN12Q6JVE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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LCN12Q6JVE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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LCN12Q6JVE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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