Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RALGAPA1Q6GYQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RALGAPA1Q6GYQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms