Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTRHD1Q6GMV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTRHD1Q6GMV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTRHD1Q6GMV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTRHD1Q6GMV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTRHD1Q6GMV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTRHD1Q6GMV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTRHD1Q6GMV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTRHD1Q6GMV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms