Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LHX8Q68G74 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LHX8Q68G74 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LHX8Q68G74 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LHX8Q68G74 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LHX8Q68G74 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LHX8Q68G74 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms