Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RNF123Q5XPI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF123Q5XPI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF123Q5XPI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RNF123Q5XPI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms