Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD17Q5XLA6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD17Q5XLA6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CARD17Q5XLA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CARD17Q5XLA6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms