Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM29Q5VYK3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ECM29Q5VYK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ECM29Q5VYK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ECM29Q5VYK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ECM29Q5VYK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ECM29Q5VYK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms