Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
OTUD1Q5VV17 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD1Q5VV17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD1Q5VV17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD1Q5VV17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD1Q5VV17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD1Q5VV17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms