Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
SNAPC4Q5SXM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SNAPC4Q5SXM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SNAPC4Q5SXM2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SNAPC4Q5SXM2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
SNAPC4Q5SXM2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SNAPC4Q5SXM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms