Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VAX1Q5SQQ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAX1Q5SQQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAX1Q5SQQ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms