Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRB2Q5IJ48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRB2Q5IJ48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRB2Q5IJ48 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms