Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD39Q53RE8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD39Q53RE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD39Q53RE8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms