Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01620Q4KN68 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01620Q4KN68 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01620Q4KN68 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms