Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFAP221Q4G0U5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP221Q4G0U5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP221Q4G0U5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP221Q4G0U5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP221Q4G0U5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms