Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF212Q495C1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF212Q495C1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF212Q495C1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms