Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
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