Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP3Q15836 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP3Q15836 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP3Q15836 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms