Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC1Q15751 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC1Q15751 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC1Q15751 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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