Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYR3Q15413 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYR3Q15413 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RYR3Q15413 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RYR3Q15413 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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