Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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