Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRD3Q15059 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRD3Q15059 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD3Q15059 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD3Q15059 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRD3Q15059 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRD3Q15059 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms