Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms