Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMC1AQ14683 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMC1AQ14683 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMC1AQ14683 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC1AQ14683 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC1AQ14683 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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