Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCARF1Q14162 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCARF1Q14162 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SCARF1Q14162 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCARF1Q14162 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCARF1Q14162 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCARF1Q14162 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCARF1Q14162 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
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