Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBFBQ13951 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBFBQ13951 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBFBQ13951 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CBFBQ13951 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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