Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PICALMQ13492 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PICALMQ13492 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PICALMQ13492 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PICALMQ13492 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PICALMQ13492 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PICALMQ13492 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PICALMQ13492 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PICALMQ13492 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms