Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA1Q13136 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA1Q13136 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA1Q13136 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA1Q13136 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA1Q13136 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
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