Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKAA1Q13131 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKAA1Q13131 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAA1Q13131 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKAA1Q13131 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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