Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFX1Q12986 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFX1Q12986 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFX1Q12986 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFX1Q12986 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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