Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-205ENST00000483329 819 ntTSL 512.85□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 MON1B-207ENST00000566455 2864 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 22.2
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GRSF1Q12849 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.89□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 21.8
GRSF1Q12849 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 21.8
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GRSF1Q12849 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.413e-19■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 WASHC4-205ENST00000548195 576 ntTSL 45.2□□□□□ -1.583e-19■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 521.09■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.565e-7■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 21.6
GRSF1Q12849 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.047e-8■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 227.09■■□□□ 1.933e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 324.42■■□□□ 1.53e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 524.42■■□□□ 1.53e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-213ENST00000530391 648 ntTSL 322.43■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 222.31■■□□□ 1.163e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.971e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 ANAPC2-206ENST00000493730 597 ntTSL 320.65■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.781e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 ANAPC2-204ENST00000485970 341 ntTSL 219.25■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 ANAPC2-205ENST00000487917 1972 ntTSL 218.94■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 218.83■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-219ENST00000532780 1194 ntTSL 218.36■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-11■■■■□ 21.4
GRSF1Q12849 WDR34-206ENST00000483181 801 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.4
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