Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 ARA1YBR149W 1035 nt10.32□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 SIR2YDL042C 1689 nt10.31□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 PPH22YDL188C 1134 nt10.31□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt10.31□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt10.31□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 YPL251WYPL251W 303 nt10.31□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 COG7YGL005C 840 nt10.3□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 SPG5YMR191W 1122 nt10.3□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 RAS1YOR101W 930 nt10.3□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 MRPL23YOR150W 492 nt10.3□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 DSE3YOR264W 1293 nt10.3□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 RIB2YOL066C 1776 nt10.29□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 HSL7YBR133C 2484 nt10.29□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 PTC7YHR076W 1032 nt10.29□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 CLB5YPR120C 1308 nt10.29□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 YBL086CYBL086C 1401 nt10.28□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 PRY1YJL079C 900 nt10.28□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 ATP12YJL180C 978 nt10.28□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 RRP40YOL142W 723 nt10.28□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 HXT12YIL170W 1374 nt10.27□□□□□ -0.76
NCR1Q12200 YEL008WYEL008W 381 nt10.27□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 HIF1YLL022C 1158 nt10.27□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 PGC1YPL206C 966 nt10.27□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 YPR150WYPR150W 522 nt10.27□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 SVF1YDR346C 1446 nt10.26□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 POP5YAL033W 522 nt10.26□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 FHN1YGR131W 525 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 SAM35YHR083W 990 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 YJR096WYJR096W 849 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 LEU9YOR108W 1815 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 BIO5YNR056C 1686 nt10.25□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 ALD4YOR374W 1560 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 ADH7YCR105W 1086 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 YGR066CYGR066C 879 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 MRPS8YMR158W 468 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 OCA1YNL099C 717 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 PCL1YNL289W 840 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.24□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 PAU15YIR041W 375 nt10.23□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 GPN2YOR262W 1044 nt10.23□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 OMA1YKR087C 1038 nt10.22□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 AVO2YMR068W 1281 nt10.22□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 YDR042CYDR042C 603 nt10.21□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 LST7YGR057C 729 nt10.21□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 SEC28YIL076W 891 nt10.21□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 BUD21YOR078W 645 nt10.21□□□□□ -0.77
NCR1Q12200 CSM1YCR086W 573 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 HXT1YHR094C 1713 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YJL055WYJL055W 738 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YML099W-AYML099W-A 330 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 NAR1YNL240C 1476 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 TIF5YPR041W 1218 nt10.2□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 LAS1YKR063C 1509 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YMR209CYMR209C 1374 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YCR025CYCR025C 411 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 RNP1YLL046C 750 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 REX3YLR107W 1215 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 SSU72YNL222W 621 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 TSR3YOR006C 942 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 BRR1YPR057W 1026 nt10.19□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 CHL4YDR254W 1377 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YFH7YFR007W 1062 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 SAW1YAL027W 786 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YMR103CYMR103C 363 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YOR364WYOR364W 369 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 snR37snR37 386 nt10.18□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 GCV1YDR019C 1203 nt10.17□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 UFO1YML088W 2007 nt10.16□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 VRG4YGL225W 1014 nt10.16□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YML101C-AYML101C-A 318 nt10.16□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 TLG2YOL018C 1194 nt10.16□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 PTI1YGR156W 1278 nt10.15□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 CPD1YGR247W 720 nt10.15□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 MEP3YPR138C 1470 nt10.15□□□□□ -0.78
NCR1Q12200 YIL092WYIL092W 1902 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 SHY1YGR112W 1170 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 MRPL49YJL096W 486 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 CWC25YNL245C 540 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 SAM3YPL274W 1764 nt10.14□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 MTQ2YDR140W 666 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 IME1YJR094C 1083 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 SPC24YMR117C 642 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 RUF5-1RUF5-1 710 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 RUF5-2RUF5-2 710 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 YPL162CYPL162C 822 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 POS5YPL188W 1245 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 ARR1YPR199C 885 nt10.13□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt10.12□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 MRPL13YKR006C 795 nt10.12□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 Q0032Q0032 291 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 YER138W-AYER138W-A 105 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 AIM23YJL131C 1071 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 ESS1YJR017C 513 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 GFD1YMR255W 567 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 MPD2YOL088C 834 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.7 ms