Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPPLY1Q0D2K3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms