Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SAC7YDR389W 1965 nt8.71□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 CDS1YBR029C 1374 nt8.71□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 EDC1YGL222C 528 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 ISY1YJR050W 708 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 RSA3YLR221C 663 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 LIP2YLR239C 987 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 SLD7YOR060C 774 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 POS5YPL188W 1245 nt8.7□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YHR140WYHR140W 720 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 MHO1YJR008W 1017 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YET2YMR040W 483 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 RRT8YOL048C 1029 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 RRP40YOL142W 723 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 ISA2YPR067W 558 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 DMA2YNL116W 1569 nt8.69□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 PHO92YDR374C 921 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 CPD1YGR247W 720 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 SNZ1YMR096W 894 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 GFD1YMR255W 567 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 DSC2YOL073C 969 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YOL107WYOL107W 1029 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 RPD3YNL330C 1302 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YBR138CYBR138C 1575 nt8.68□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YGR011WYGR011W 327 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YHR022CYHR022C 771 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 ACO2YJL200C 2370 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 YLR169WYLR169W 354 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 FAR3YMR052W 615 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 TSR3YOR006C 942 nt8.67□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 DAK2YFL053W 1776 nt8.66□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 TIP1YBR067C 633 nt8.66□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 PSD1YNL169C 1503 nt8.65□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 ADE8YDR408C 645 nt8.65□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 TIM44YIL022W 1296 nt8.65□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 CWP2YKL096W-A 279 nt8.65□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 VMA11YPL234C 495 nt8.65□□□□□ -1.02
HDA3Q06623 ATG23YLR431C 1362 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 MED2YDL005C 1296 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 MMS2YGL087C 414 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 AIM2YAL049C 741 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 PRM4YPL156C 855 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YRF1-2YER190W 5046 nt8.64□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YJR114WYJR114W 393 nt8.63□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 DIT1YDR403W 1611 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 ORM1YGR038W 669 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YGR283CYGR283C 1026 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 MDM35YKL053C-A 261 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 SRL2YLR082C 1179 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 snR189snR189 189 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 ESBP6YNL125C 2022 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 RTG3YBL103C 1461 nt8.62□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 ADD66YKL206C 804 nt8.61□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YNL303WYNL303W 348 nt8.61□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YPR126CYPR126C 309 nt8.61□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 CCT5YJR064W 1689 nt8.61□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 ILV2YMR108W 2064 nt8.6□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 CDC10YCR002C 969 nt8.6□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 OPI3YJR073C 621 nt8.6□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YLR198CYLR198C 360 nt8.6□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 CYT1YOR065W 930 nt8.6□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YJR115WYJR115W 510 nt8.59□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 YNR064CYNR064C 873 nt8.59□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 SNX3YOR357C 489 nt8.59□□□□□ -1.03
HDA3Q06623 SAS4YDR181C 1446 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 TRP4YDR354W 1143 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 JJJ3YJR097W 519 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 MGM101YJR144W 810 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 YKR104WYKR104W 921 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 SEN2YLR105C 1134 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 RSF1YMR030W 1131 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 OSW1YOR255W 837 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 UBS1YBR165W 834 nt8.58□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 YHR218WYHR218W 1812 nt8.57□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 ESS1YJR017C 513 nt8.57□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 DML1YMR211W 1428 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 TVP23YDR084C 600 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 FSH1YHR049W 732 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 CSI1YMR025W 888 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 AVO2YMR068W 1281 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 YMR262WYMR262W 942 nt8.56□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 CLB5YPR120C 1308 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 CTI6YPL181W 1521 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 HXT10YFL011W 1641 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 URA8YJR103W 1737 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 HAT2YEL056W 1206 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 SPS100YHR139C 981 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 RPC31YNL151C 756 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 ARC35YNR035C 1029 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 IML3YBR107C 738 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 YMR265CYMR265C 1386 nt8.55□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 THI72YOR192C 1800 nt8.54□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 TRP1YDR007W 675 nt8.54□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 PCL1YNL289W 840 nt8.54□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 SUT2YPR009W 807 nt8.54□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 AAC3YBR085W 924 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 RIM2YBR192W 1134 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 RER1YCL001W 567 nt8.53□□□□□ -1.04
HDA3Q06623 WHI4YDL224C 1950 nt8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms