Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FPGSQ05932 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FPGSQ05932 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FPGSQ05932 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FPGSQ05932 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FPGSQ05932 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FPGSQ05932 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FPGSQ05932 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FPGSQ05932 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FPGSQ05932 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms