Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT17Q04695 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT17Q04695 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT17Q04695 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT17Q04695 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms