Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 BUD31YCR063W 474 nt6.52□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 YCP4YCR004C 744 nt6.51□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 CYC3YAL039C 810 nt6.51□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 UFD1YGR048W 1086 nt6.5□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 DIP5YPL265W 1827 nt6.5□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 ENO1YGR254W 1314 nt6.5□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 GLY1YEL046C 1164 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 RNA170RNA170 169 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 NDE2YDL085W 1638 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 TIF3YPR163C 1311 nt6.49□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 MRN1YPL184C 1839 nt6.48□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 SAM50YNL026W 1455 nt6.47□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 PFS2YNL317W 1398 nt6.47□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 MDH2YOL126C 1134 nt6.47□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 LRO1YNR008W 1986 nt6.47□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 INO1YJL153C 1602 nt6.47□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 PMT7YDR307W 1989 nt6.46□□□□□ -1.37
YHP1Q04116 SER2YGR208W 930 nt6.46□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 YNL140CYNL140C 570 nt6.46□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 HSV2YGR223C 1347 nt6.46□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 EHT1YBR177C 1356 nt6.45□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 RSC4YKR008W 1878 nt6.45□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 TGL5YOR081C 2250 nt6.45□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 SRP102YKL154W 735 nt6.45□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 HTS1YPR033C 1641 nt6.44□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 WSC4YHL028W 1818 nt6.44□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 INM1YHR046C 888 nt6.44□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 YLR280CYLR280C 351 nt6.44□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 YIA6YIL006W 1122 nt6.43□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 TDA4YJR116W 840 nt6.43□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 MET22YOL064C 1074 nt6.43□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 RIB1YBL033C 1038 nt6.42□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 ERO1YML130C 1692 nt6.42□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 MET13YGL125W 1803 nt6.41□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.41□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 YLR460CYLR460C 1131 nt6.41□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 PDC6YGR087C 1692 nt6.41□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 ALG7YBR243C 1347 nt6.41□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 SLM3YDL033C 1254 nt6.4□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 SOD2YHR008C 702 nt6.4□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 RCF1YML030W 480 nt6.4□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 YMR007WYMR007W 381 nt6.4□□□□□ -1.38
YHP1Q04116 SWM1YDR260C 513 nt6.39□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 CHS7YHR142W 951 nt6.39□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 RCR1YBR005W 642 nt6.39□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 ARO3YDR035W 1113 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 YGR210CYGR210C 1236 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 OCH1YGL038C 1443 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 PMT1YDL095W 2454 nt6.38□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 WSC3YOL105C 1671 nt6.37□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 KTR4YBR199W 1395 nt6.37□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 FCY1YPR062W 477 nt6.37□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 SHC1YER096W 1539 nt6.36□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.36□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 MRP7YNL005C 1116 nt6.36□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 LPD1YFL018C 1500 nt6.35□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 PUP3YER094C 618 nt6.35□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 OLA1YBR025C 1185 nt6.35□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 RHO1YPR165W 630 nt6.35□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 FRA1YLL029W 2250 nt6.35□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 HXT8YJL214W 1710 nt6.34□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 ERG6YML008C 1152 nt6.34□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 YMR166CYMR166C 1107 nt6.34□□□□□ -1.39
YHP1Q04116 TPO1YLL028W 1761 nt6.34□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 SGF73YGL066W 1974 nt6.33□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 CAK1YFL029C 1107 nt6.33□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 ELP6YMR312W 822 nt6.33□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 NSG2YNL156C 900 nt6.33□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 YPL108WYPL108W 507 nt6.33□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 AIM34YMR003W 597 nt6.31□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 PDC5YLR134W 1692 nt6.3□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 YGR137WYGR137W 375 nt6.3□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.3□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 TOM71YHR117W 1920 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 THI73YLR004C 1572 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 PRC1YMR297W 1599 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 YNL190WYNL190W 615 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 LSP1YPL004C 1026 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 ITR1YDR497C 1755 nt6.29□□□□□ -1.4
YHP1Q04116 MTC6YHR151C 1581 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 RRT6YGL146C 936 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 CDA1YLR307W 906 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 MAS1YLR163C 1389 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 PEX28YHR150W 1740 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 HXT9YJL219W 1704 nt6.27□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 MCM5YLR274W 2328 nt6.26□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 CKB1YGL019W 837 nt6.26□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 SNP1YIL061C 903 nt6.26□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 RRT14YIL127C 621 nt6.26□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 BEM1YBR200W 1656 nt6.26□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 TIM50YPL063W 1431 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 RSC9YML127W 1746 nt6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.3 ms