Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MUC3AQ02505 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MUC3AQ02505 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MUC3AQ02505 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC3AQ02505 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MUC3AQ02505 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms