Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSC2Q02487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC2Q02487 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC2Q02487 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSC2Q02487 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSC2Q02487 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms