Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MC1RQ01726 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MC1RQ01726 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MC1RQ01726 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MC1RQ01726 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms