Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA6Q01524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA6Q01524 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA6Q01524 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEFA6Q01524 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms