Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
B4GALNT1Q00973 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4GALNT1Q00973 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4GALNT1Q00973 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms