Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDLBPQ00341 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HDLBPQ00341 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
HDLBPQ00341 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HDLBPQ00341 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms