Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms